利用PMA对样品DNA进行前处理，区分样品中益生菌的死活。基于荧光定量PCR确定PMA活菌染色条件，并联合微滴式数字PCR方法，快速检测食品中益生菌的活菌数，形成相应的标准检测流程，为政府和行业提供技术保障和监管建议。
2. 荧光定量PCR法（株水平）
基于全基因组-单核苷酸多态性位点分析及荧光定量PCR建立特异性好、重复性强，可稳定遗传的益生菌株水平定量检测方法，可用于消费市场的检验监管和企业生产质控，对于促进食品中益生菌菌株特异性检测的标准化进程具有重要意义。
3. 益生菌功效评价
将比较基因组分析及表型验证引入我国自主研发益生菌安全性及功能性评价工作中，建立全面的益生菌菌株的评价体系，为打破我国乳制品的直投式发酵剂依赖进口的壁垒提供数据支持，为国产新兴益生菌的产业化提供理论依据。
